분자

3D 분자 데이터를 위한 Wandb 클래스입니다.

Molecule(
    data_or_path: Union[str, 'TextIO'],
    caption: Optional[str] = None,
    **kwargs
) -> None

인수
data_or_path	(문자열, io) 파일 이름이나 io 오브젝트로 분자를 초기화할 수 있습니다.
caption	(문자열) 분자를 표시할 때 연결된 캡션입니다.

메소드

from_rdkit

소스 보기

@classmethod
from_rdkit(
    data_or_path: "RDKitDataType",
    caption: Optional[str] = None,
    convert_to_3d_and_optimize: bool = (True),
    mmff_optimize_molecule_max_iterations: int = 200
) -> "Molecule"

RDKit에서 지원하는 파일/오브젝트 유형을 wandb.Molecule로 변환합니다.

인수
data_or_path	(문자열, rdkit.Chem.rdchem.Mol) 파일 이름이나 rdkit.Chem.rdchem.Mol 오브젝트로 분자를 초기화할 수 있습니다.
caption	(문자열) 분자를 표시할 때 연결된 캡션입니다.
convert_to_3d_and_optimize	(불리언) 3D 좌표를 가진 rdkit.Chem.rdchem.Mol로 변환합니다. 이는 복잡한 분자에 대해서는 많은 시간이 걸릴 수 있는 비용이 많이 드는 작업입니다.
mmff_optimize_molecule_max_iterations	(정수) rdkit.Chem.AllChem.MMFFOptimizeMolecule에서 사용할 반복 횟수입니다.

from_smiles

소스 보기

@classmethod
from_smiles(
    data: str,
    caption: Optional[str] = None,
    sanitize: bool = (True),
    convert_to_3d_and_optimize: bool = (True),
    mmff_optimize_molecule_max_iterations: int = 200
) -> "Molecule"

SMILES 문자열을 wandb.Molecule로 변환합니다.

인수
data	(문자열) SMILES 문자열입니다.
caption	(문자열) 분자를 표시할 때 연결된 캡션입니다.
sanitize	(불리언) RDKit의 정의에 따라 분자가 화학적으로 합리적인지 확인합니다.
convert_to_3d_and_optimize	(불리언) 3D 좌표를 가진 rdkit.Chem.rdchem.Mol로 변환합니다. 이는 복잡한 분자에 대해서는 많은 시간이 걸릴 수 있는 비용이 많이 드는 작업입니다.
mmff_optimize_molecule_max_iterations	(정수) rdkit.Chem.AllChem.MMFFOptimizeMolecule에서 사용할 반복 횟수입니다.

클래스 변수
SUPPORTED_RDKIT_TYPES
SUPPORTED_TYPES